Ο Πομπήιος νικήθηκε στη μάχη των Φαρσάλων από τον Καίσαρα και κατέφυγε στην Αίγυπτο. Εκεί δολοφονήθηκε κατ’ εντολήν του Πτολεμαίου ΙΓ΄, ο οποίος πίστευε πως με αυτόν τον τρόπο θα γινόταν αρεστός στον Καίσαρα.
Όμως ο Ρωμαίος στρατηγός, ενεπλάκη στον εμφύλιο της Αιγύπτου με αντίπαλο στρατόπεδο. Συμμάχησε με την αδερφή του Πτολεμαίου, Κλεοπάτρα Ζ΄ της Αιγύπτου, και μαζί νίκησαν τις δυνάμεις της Αρσινόης Δ’ της Αιγύπτου και του Πτολεμαίου στη Μάχη του Νείλου.
Από τον Σεπτέμβριο του 48 π.Χ. έως τον Ιανουάριο του 47 π.Χ., ο Καίσαρας πολιορκούσε την Αλεξάνδρεια της Αιγύπτου με περίπου 4.000 άντρες. Το τί έγινε κατά την πολιορκία και τη μάχη μπορείτε να δείτε στο εξαιρετικό ντοκιμαντέρ των Kings and Generals:
